Metagenomica este definită ca analiza genetică directă a genomurilor conținute cu o probă de mediu Domeniul a început inițial cu clonarea ADN-ului de mediu, urmată de screening-ul expresiei funcționale [1], și a fost apoi completată rapid de secvențierea directă aleatorie cu pușcă a ADN-ului mediului [2, 3].
Care este procesul metagenomicii?
Metagenomica implică obținerea de ADN din toate microorganismele dintr-o comunitate, fără a identifica neapărat toate speciile implicate. După ce genele sunt secvențiate și comparate cu secvențele identificate, funcțiile acestor gene pot fi determinate.
Ce tehnică este folosită în metagenomică?
O probă din comunitatea microbiană este colectată din apă de mare, sediment, animal gazdă sau alt habitat marin. Celulele colectate sunt apoi lizate și ADN-ul este extras din lizatul lor. Tehnica care face posibilă metagenomica este shotgun sequencing, care secvențiază regiuni aleatorii ale ADN-ului într-un mod nețintit.
Care sunt cei 3 pași pentru studiul metagenomică?
Pași și proces de metagenomică:
- Colectie de mostre:
- extracție ADN:
- Pregătirea probei:
- Eșantion de analiză:
Cum se realizează metagenomica funcțională?
Metagenomica funcțională implică izolarea ADN-ului din comunitățile microbiene pentru a studia funcțiile proteinelor codificate. Aceasta implică clonarea fragmentelor de ADN, exprimarea genelor într-o gazdă surogat și screening-ul pentru activități enzimatice.
