Modelarea omologiei obține structura tridimensională a unei proteine țintă bazată pe asemănarea dintre secvențele șablon și țintă și această tehnică se dovedește a fi eficientă atunci când vine vorba de studiul proteinelor membranare care sunt greu de cristalizat ca GPCR, deoarece oferă un grad mai ridicat de înțelegere a …
Ce este modelarea omologiei și de ce este necesară?
1.2.
Modelarea omologiei este metoda de calcul cea mai precisă pentru a crea modele structurale de încredere și este folosită în mod obișnuit în multe aplicații biologice. Modelarea omologiei prezice structura 3D a unei proteine de interogare prin alinierea secvenței proteinelor șablon.
Care este principiul modelării omologiei?
Modelarea omologiei este, de asemenea, cunoscută ca modelare comparativă, prezice structurile proteinelor pe baza omologiei de secvență cu structuri cunoscute. Se bazează pe principiul că „ dacă două proteine au o asemănare de secvență suficient de mare, este posibil ca acestea să aibă structuri tridimensionale foarte asemănătoare.”
Ce face o modelare bună de omologie?
Dacă definim un „model de omologie de mare succes” ca unul având <=2 Å rmsd din structura empirică, atunci șablonul trebuie să aibă >=60% identitate de secvență cu ținta pentru succes rata >70% Chiar și la identități de secvență ridicată (60%-95%), până la unul din zece modele de omologie au un rmsd >5 Å vs.
Care dintre următoarele este adevărată despre modelarea omologiei?
Explicație: După cum sugerează și numele, modelarea omologiei predice structurile proteinelor pe baza omologiei de secvență cu structuri cunoscute Modelarea omologiei produce un model al tuturor atomilor bazat pe alinierea cu proteinele șablon.… Erorile făcute în pasul de aliniere nu pot fi corectate în următorii pași de modelare.
