BLAST este un algoritm de computer care este disponibil pentru utilizare online pe site-ul web al Centrului Național pentru Informații Biotehnologice (NCBI), precum și pe multe alte site-uri. BLAST poate alinia și compara rapid o secvență de ADN de interogare cu o bază de date de secvențe, ceea ce o face un instrument esențial în cercetarea genomică în curs.
Este BLAST o bază de date primară?
BLAST este cel mai utilizat software în cercetarea bioinformatică. Funcția sa principală este de a compara o secvență de interes, secvența de interogare, cu secvențele dintr-o bază de date mare BLAST, apoi raportează cele mai bune potriviri, sau „accesări”, găsite în baza de date. Acest program simplu are două aplicații principale.
Este NCBI o bază de date?
NCBI găzduiește o serie de baze de date relevante pentru biotehnologie și biomedicină și este o resursă importantă pentru instrumente și servicii de bioinformatică. Bazele de date majore includ GenBank pentru secvențe ADN și PubMed, o bază de date bibliografică pentru literatura biomedicală. Alte baze de date includ baza de date NCBI Epigenomics.
Este BLAST folosit doar în bazele de date NCBI?
BLAST este disponibil pe web pe site-ul NCBI. Sunt disponibile diferite tipuri de BLAST în funcție de secvențele de interogare și de bazele de date țintă.
Cum funcționează baza de date BLAST?
Cum funcționează BLAST? BLAST identifică secvențe omoloage folosind o metodă euristică care găsește inițial potriviri scurte între două secvențe; astfel, metoda nu ia în considerare întregul spațiu al secvenței. După potrivirea inițială, BLAST încearcă să înceapă aliniamente locale de la aceste potriviri inițiale.
