BigWig este un format de fișier pentru afișarea datelor dense și continue într-o pistă a browserului genomului, creat prin conversia din formatul Wiggle (WIG). Formatul BigWig este descris pe site-ul web UCSC Genome Bioinformatics, iar ghidul de format al fișierelor Broad Institute oferă informații suplimentare.
Ce este formatul bigWig?
Formatul bigWig este pentru afișarea datelor dense, continue, care vor fi afișate sub formă de grafic Fișierele BigWig sunt create inițial din fișiere de tip WIG, folosind programul UCSC wigToBigWig. Ca alternativă, fișierele bigWig pot fi create din fișierele bedGraph, folosind programul UCSC bedGraphToBigWig.
Cum folosesc fișierul bigWig?
Mutați fișierul bigWig nou creat (myBigWig.bw) la o locație http, https sau ftp accesibilă pe web. Inserați adresa URL în formularul de intrare personalizat sau construiți o urmărire personalizată folosind o singură linie de urmărire. Inserați linia de melodie personalizată în caseta de text de pe pagina de gestionare a melodiilor personalizate.
Ce este o piesă bigWig?
bigWig Tracks sunt track pentru semnale continue pe întregul genom. Acestea sunt potrivite pentru afișarea diferitelor rezultate „brute” ale experimentului, cum ar fi semnale ChIP-Seq, semnale ARN-Seq etc.
Cum creez un fișier BigWig?
Există mai multe moduri de a genera fișiere mari. Aceasta implică de obicei conversia unui. bam într-o pistă de mișcare (.wig) și apoi conversia piesei de mișcare într-o pistă binar (.
