SDS se leagă puternic de resturile încărcate pozitiv și hidrofobe ale proteinelor prin grupările sale sulfat și lanțurile alchil , respectiv13 În consecință, este un detergent valoros în domeniul biologiei structurale și al studiilor de pliere/desfășurare a proteinelor.
Ce face SDS unei proteine?
SDS este un surfactant amfipatic. denaturează proteinele prin legarea de lanțul proteic cu coada sa de hidrocarbură, expunând regiunile îngropate în mod normal și acoperind lanțul proteic cu molecule de surfactant. Grupul de cap polar al SDS adaugă un beneficiu suplimentar la utilizarea acestui denaturant.
Cum se leagă SDS de aminoacizi?
SDS are o coadă hidrofobă care interacționează puternic cu lanțurile de proteine (polipeptide). Numărul de molecule SDS care se leagă de o proteină este proporțional cu numărul de aminoacizi care alcătuiesc proteina Fiecare moleculă SDS contribuie cu două sarcini negative, copleșind orice sarcină pe care o poate avea proteina.
SDS acoperă proteinele?
SDS, de asemenea, acoperă proteina cu o sarcină negativă uniformă, care maschează sarcinile intrinseci ale grupurilor R. SDS se leagă destul de uniform de proteinele liniare (aproximativ 1,4 g SDS/ 1 g proteină), ceea ce înseamnă că încărcătura proteinei este acum aproximativ proporțională cu greutatea sa moleculară.
Cum dă SDS o sarcină negativă proteinelor?
SDS este un detergent care conține un lanț alifatic lung și o grupare sulfat. Acest detergent interacționează cu proteine denaturate pentru a forma un complex puternic încărcat negativ (sarcina negativă care rezultă din SO42 − grupuri de SDS). Proteinele sunt mai întâi denaturate prin căldură și apoi SDS este adăugat în exces mare.
